与其他农作物一样，马铃薯在生长期间也会受到病虫害的影响，如果不能有效防治相关病虫害，将对马铃薯的产量、质量造成直接影响。一般马铃薯常见的病害有病毒病、黑胫病、早疫病、晚疫病、环腐病等，而常见的虫害有地老虎、蚜虫、瓢虫、金针虫等。从现实情况来看，对于马铃薯产量与质量影响最大的是晚疫病、早疫病与环腐病，对此可以采取以下措施予以防治：
1、晚疫病：对于这一病害的防治，目前主要是以预防为主，如选用无病种薯，然后通过改进栽培技术、加强药剂防治等综合防治手段进行预防。首先必须指出的是，在进行药物防治时，首先要选择合适的药物，如每667m2使用72%霜脲锰锌500倍液、75%代森锰锌600倍液等喷雾；其次，则要注意不能长时间使用某一药剂，因为这样可能会降低防治效果；再次，做到科学用药，以免对周边环境造成破坏。
|马铃薯晚疫病
2、早疫病：首先要做好肥水管理，提升植株的抗病能力，其中应重点关注基肥的施加，并结合实际情况进行磷钾肥的施加；最后，则要与非茄科作物轮作倒茬；最后则是采用药物防治，如在发病初期可以使用75%百菌清600～800倍液、80%代森锌600～800倍液等，喷洒间隔为每5天1次，总共需要喷洒3～4次。
|马铃薯早疫病
3、环腐病:是一种细菌性病害，通常发生在冷凉地区，病原菌在土壤中不能长期存活，通常是在种薯块中存活，传播途径就是通过切刀或者包装袋传染，也可以通过蚜虫等其他昆虫刺吸叶片汁液时传播。防治方法：①加强田间管理，尽量降低土温，防除发病株感染，发现感病植株后及时拔除销毁。②每1000kg的种块用25kg的滑石粉加250g左右的农用链霉素拌种杀灭病原菌，然后播种。③推广小整薯播种。④切刀消毒，在切种时采用千分之一的高锰酸钾溶液进行切刀消毒。⑤建立无病繁殖基地，进行脱毒育种。
|马铃薯坏腐病
在应用马铃薯绿色高产高效栽培技术的过程中，一定要加强对主要病虫害的防治，具体实践中尤其要重视多种防治措施的综合应用，如化学防治措施、物理防治措施、生物防治措施等，同时还要借助先进的技术手段，加强对病虫害的监测，这样才能及时发现和处理已经发生的病虫害，避免其出现大面积传播，从而达到理想的防治效果。
